SubstanceSourceMaterial — Origine biologique d'une substance

Décrit l'organisme vivant dont est issue une substance d'extraction : règne (plante, animal, microbe, minéral), espèce taxonomique, partie utilisée (écorce, racine, sang, fermentation), zone géographique de récolte.

Objet de la ressource

Une fraction substantielle de la pharmacopée vient encore d'extraits naturels — taxol (écorce de Taxus brevifolia), morphine (Papaver somniferum), vincristine (Catharanthus roseus), insuline animale historique, héparine porcine, vaccins cultivés sur œuf, anticorps de chevaux ou de chèvres, antitoxine botulique. Pour qu'une telle substance soit enregistrable, sa source biologique doit être tracée précisément.

SubstanceSourceMaterial structure cette traçabilité avec le rang taxonomique (règne, phylum, classe, ordre, famille, genre, espèce), la partie utilisée, l'état (frais, sec, lyophilisé), l'étape de développement (germination, floraison, maturité), et la zone géographique de récolte (essentielle pour la pharmacopée traditionnelle).

Champs clés

Exemple JSON

Origine du Taxol : extraction historique à partir de l'écorce fraîche de Taxus brevifolia récolté dans le Pacific Northwest (États-Unis).

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Usages typiques

• Phytomédicaments : tisanes, teintures, extraits standardisés.
• Médicaments d'origine animale : héparine, insuline bovine/porcine historique, anti-venin, gélatine.
• Vaccins : culture sur œuf embryonné, fermentation, culture cellulaire.
• Probiotiques : souches définies par espèce + lignée.
• Médecine traditionnelle : codification de la phytothérapie chinoise (TCM), ayurvédique.

Pièges courants

• Nom vernaculaire : « Pavot » n'est pas codable. Toujours utiliser le binôme latin (Papaver somniferum) + un identifiant NCBI Taxonomy.
• Origine géographique vague : « Asie » ne suffit pas. Pour la traçabilité CITES et la lutte contre la contrefaçon, préciser pays ou région géographique reconnue.
• Partie non précisée : « Echinacée » est ambigu : racine, partie aérienne ou plante entière ? Composition chimique différente selon la partie.
• Stade de développement omis : la concentration en alcaloïdes d'une plante varie fortement entre floraison et maturité.
• Confusion avec SubstanceDefinition : SubstanceSourceMaterial décrit l'origine, SubstanceDefinition la substance chimique extraite. Distincts mais liés (un Taxus brevifolia source produit un Taxol défini).

Ressources liées

• SubstanceDefinition — référence ce bloc dans sourceMaterial.
• SubstanceNucleicAcid, SubstancePolymer, SubstanceProtein, SubstanceReferenceInformation.
• MedicinalProductDefinition — produit fini.
• Ingredient — ingrédient d'origine naturelle.

Voir aussi : SubstanceDefinition et Ingredient.